La classe de CP est en sortie scolaire au musée des dinosaures. Mais au moment de pique-niquer, leur repas a disparu ! Il va falloir faire vite pour le retrouver, car tous les élèves sont affamés ! Heureusement, Lilou et Sékou ont repéré des indices...
C'est la fin de la journée, l'heure d'aller à la garderie. La maîtresse demande à Lilou et Sékou de porter un papier au maître de CM1. Mais il refuse d'ouvrir la porte... et un hououou retentit de l'intérieur. Un peu inquiets, les enfants enquêtent et découvrent des poils et une drôle de tache rouge. C'est alors que la porte de la classe s'ouvre avec le maître et... son petit chien, Garou, un loulou !
C'est la rentrée pour les CP ! Mais il se passe de drôles de choses en classe : des bruits bizarres, des gouttes d'eau qui tombent du plafond... Et s'il y avait un fantôme dans l'école ? Pour le savoir, Lilou et Sékou mènent l'enquête...
Aujourd'hui, c'est le carnaval : tous les enfants sont déguisés, impatients d'aller défiler... Mais soudain, l'alarme incendie retentit. Pourtant, rien ne brûle. Qui a bien pu la déclencher ? Lilou et Sékou mènent l'enquête...
Que se passe-t-il à l'école ? À la cantine, les couverts ont disparu, et la directrice aussi ! Un voleur se serait-il glissé dans l'école ? Lilou et Sékou mènent l'enquête...
Ce matin, Fifi et Nono, les gerbilles de la classe, ne sont plus dans leur cage. Mais où sont-elles passées ? Lilou et Sékou mènent l'enquête... Vont-ils les retrouver ?